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安東帕:實(shí)驗(yàn)室SAXS儀器對HAS蛋白進(jìn)行SEC-SAXS聯(lián)用

時(shí)間:2020-04-02 11:58來源:金利儀器 作者:金利儀器 點(diǎn)擊:
安東帕:實(shí)驗(yàn)室SAXS儀器對HAS蛋白進(jìn)行SEC-SAXS聯(lián)用。 小角X-射線散射廣泛應(yīng)用于結(jié)構(gòu)生物學(xué)來確定蛋白質(zhì)的尺寸和形狀。溶液中的生物大分子可以以多種構(gòu)象存在,并且一般具有很強(qiáng)的團(tuán)聚傾向,在沒有預(yù)先純化的情況下,對此類分子的數(shù)據(jù)解釋有時(shí)會很繁瑣。 分子
  

       安東帕:實(shí)驗(yàn)室SAXS儀器對HAS蛋白進(jìn)行SEC-SAXS聯(lián)用。

       小角X-射線散射廣泛應(yīng)用于結(jié)構(gòu)生物學(xué)來確定蛋白質(zhì)的尺寸和形狀。溶液中的生物大分子可以以多種構(gòu)象存在,并且一般具有很強(qiáng)的團(tuán)聚傾向,在沒有預(yù)先純化的情況下,對此類分子的數(shù)據(jù)解釋有時(shí)會很繁瑣。
       分子排阻凝膠色譜 (SEC) 能夠根據(jù)分子的大小進(jìn)行分離。SEC 與SAXS 聯(lián)用可以顯著提高數(shù)據(jù)質(zhì)量,從而提高數(shù)據(jù)解釋的準(zhǔn)確性。
       小角X-射線散射 (SAXS) 是生物化學(xué)等大分子樣品研究中常用的方法。在過去的幾年里,由于光束傳輸(第3代和第4代同步加速器、現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)室X-射線源)、探測技術(shù)和數(shù)據(jù)解析方面的進(jìn)步,SAXS 測量取得了顯著的增長。
       在現(xiàn)代同步加速器設(shè)備中,分子排阻凝膠色譜 (SEC) 是在SAXS線站上建立的一種制備方法。尺寸不同的分子混合物(如單體、二聚體等)經(jīng)過SEC純化,可以得到單分散組分。其基本原理是不同尺寸的大分子在多孔色譜樹脂上的停留時(shí)間不同。因此,大分子比小分子的洗脫速度快,使得按大小將單個(gè)的餾分分開。SEC實(shí)驗(yàn)通常是通過紫外吸收測量來確定哪個(gè)時(shí)間哪個(gè)組分被洗脫。
       實(shí)驗(yàn)室儀器的最新進(jìn)展(如基于液態(tài)金屬靶材或高功率的封閉靶等高性能SAXS儀器)使得這種方法也可以適用于實(shí)驗(yàn)室設(shè)備,為研究和常規(guī)測量提供了更多的可能性。這里我們所示的SEC-SAXS 聯(lián)合實(shí)驗(yàn)是在安東帕的SAXSpace儀器上對HSA蛋白樣品進(jìn)行的,以說明在實(shí)驗(yàn)室儀器上進(jìn)行測量的潛力。
       使用標(biāo)準(zhǔn)的FPLC系統(tǒng)和安東帕SAXSpace儀器搭建在線SEC–SAXS 。由于在線測量的性質(zhì),樣品的特定組分從SEC柱中洗脫時(shí)直接測量。
       利用現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)室SAXS儀器的高通量,可以在短時(shí)間內(nèi)獲得足夠好信噪比的蛋白質(zhì)散射數(shù)據(jù)。
       通過將人血清白蛋白HSA溶解到緩沖溶液中,制備了人血清白蛋白樣品溶液。所使用的緩沖溶液 (pH 7.5) 組分為20 mM 三(三(羥甲基)氨基甲烷)、150 mMol NaCl和3 % 的甘油。最終HSA濃度為20 mg/mL。
       樣品在注射到SEC柱之前沒有經(jīng)過進(jìn)一步的純化。使用GE Äkta Pure 25 FPLC儀器進(jìn)行了分子排阻色譜分析。
       SAXSpace 儀器的FlowCell中的管子可直接連接到Äkta Pure 25 SEC 儀器UV 傳感器的出口,以盡量減小管子長度。
       對單體蛋白質(zhì)分子的原始散射數(shù)據(jù)進(jìn)行進(jìn)一步的分析。確定了單體洗脫峰的散射曲線,并取其平均值?偣驳玫搅诉@個(gè)區(qū)域內(nèi)具有恒定散射曲線的10幀數(shù)據(jù)。然后使用 SAXSanalysis 軟件對這10幀數(shù)據(jù)進(jìn)行平均并進(jìn)行背景扣除
       即使在總共只有100 s的極短曝光時(shí)間內(nèi),也能獲得極好的數(shù)據(jù)質(zhì)量。這允許使用SAXSanalysis 對散射曲線進(jìn)行Guinier外推來計(jì)算回轉(zhuǎn)半徑(Rg)。
       Rg值為2.8 nm,這與文獻(xiàn)值吻合較好。
       為了獲得實(shí)空間結(jié)構(gòu)的信息,利用GIFT軟件對散射曲線進(jìn)行了傅里葉變換。
       在實(shí)驗(yàn)室儀器如安東帕SAXSpace和SAXSpoint等儀器上使用在線SEC-SAXS大大提高了在自己實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行蛋白質(zhì)分析的可能性。
       即使是具有很強(qiáng)團(tuán)聚傾向的蛋白質(zhì)也很容易被測定,因?yàn)榉蛛x和測定之間沒有延遲。由于測量可以在停止流動(dòng)模式下,因此也可以測量高度稀釋低聚物和弱散射小分子。這進(jìn)一步減少了同步加速器測量的需求,減少了旅行時(shí)間和敏感樣品的運(yùn)輸。
 
(責(zé)任編輯:金利儀器lyh)
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